Предметы, найденные у ворот, сегодня являются жемчужиной Государственного археологического музея, расположенного в Афинах. Шлиман также раскопал «южный дом», который он назвал дворцом Агамемнона. Но более богатый и большой дворец был найден намного позже, точнее около самой вершины акрополя.

Сегодня этот сложный комплекс зданий, построенный около XIII столетия до н. э., представляет собой чуть-чуть возвышающиеся над землей многочисленные руины, хотя даже под ними легко рассмотреть оригинальную и необычную планировку. Ванна, оштукатуренная в красный цвет, (она считается местом убийства Агамемнона) и сегодня легко различима в северном помещении комплекса. Интересна «секретная цистерна», расположенная в восточном конце дворца (относится примерно к 1225 году до н. э.), которая одинаково пригодна и для обороны, и для сбора воды (глубоко в подвале есть родник, к которому ведет узкая лестница). Недалеко возвышается «Дом колонн». Это величественное здание с шикарной лестницей, ведущей на второй этаж.

Лишь микенская элита могла проживать на территории цитадели и в ее пределах, именно поэтому основная центральная часть города расположена вне стен, то есть ближе к дороге. Здесь обнаружены различные лавки и склады, многочисленные таблички из глины с записями, которые доказывают, что в Микенах были грамотными даже простые люди, а их письменность обладала довольно развитой структурой. Вблизи «торговых комплексов» лежит «могила круга B» (ученые датируют ее 1650 годом до н. э.). В ней есть несколько захоронений, которые Шлиман идентифицировал как могилы Клитемнестры (она была женой предводителя троянской экспедиции) и Эгисфа (он считается убийцей отца Агамемнона). В 400 метрах от дороги обнаружен более потрясающий толос (своеобразное круглое сооружение, используемое как святилище или гробница), известный под названиями «гробница Агамемнона» или «казначейство Атрея» (что касается первого названия, на него претендуют сразу несколько сооружений комплекса, так что оно используется в Микенах несколько раз). Данный толос внушительных размеров построен без какого-либо связующего раствора. Его вход ведет сквозь величественный коридор в 15 метров и зал, перекрытый 2-мя огромными плитами из камня. Одна из плит составляет 9 метров в длину, а весит она 118 тонн!